La característica más distintiva del caballo Appaloosa es el pelaje moteado complejo de leopardo. Esta localización es el resultado de la superposición de los colores de la capa base. Hay otras características que son reconocibles en esta raza: la piel mancha (la aparición de manchas irregulares), los cascos desnudos y los ojos con esclerótica blanca. El moteado de la piel se puede observar en varias zonas del cuerpo, pero los más comunes son el hocico, los ojos, el ano y los genitales.

Además es común ver a los Appaloosas con los cascos desnudos, aunque no son la única raza que tiene esa característica. La tercera característica es la esclerótica blanca. La esclerótica es la parte del ojo alrededor del iris. En los seres humanos, la esclerótica es muy obvia, pero este no es el caso de la mayoría de los animales. Muchos animales tienen la esclerótica blanca, pero no es visible porque el iris es el generalmente mayor que en los seres humanos. En los caballos, la esclerótica es comúnmente negra, pero hay otros caballos, que no sea el Appaloosa que tienen una esclerótica blanca, pero por lo general sólo es visible si giran los ojos hacia atrás. En los caballos Appaloosa, la esclerótica blanca es visible en una posición normal del ojo.

Para que se le permitiera registrar un caballo en el Appaloosa_Horse_Club, el caballo tiene que tener la piel moteada y una de las otras características. Esto es así, porque de vez en cuando un caballo Appaloosa puede nacer con poco o ningún patrón manchado visible.

El tipo de cuerpo del Appaloosa varía ampliamente debido a que varias razas de caballos fueron utilizados para desarrollarlos. El peso oscila entre 950 a 1.250 kilos y la altura desde 56 hasta 64 pulgadas.

El original de Appaloosa, el llamado “tiempo viejo” o “viejo tipo” es alto, estrecho y alto y delgado. En aquel entonces, el Appaloosa fue muy influenciado por los caballos españoles. Posteriormente, los linajes ingleses se han añadido, en especial el de los caballos “pied”, que eran populares en ese momento. La raza ha sido modificada a lo largo de los años y después de la formación de la ApHC un tipo más moderno se ha desarrollado. Añadieron al Caballo Cuarto de Milla y líneas de sangre árabe que produjo Appaloosas que se desempeñan mejor en las carreras y en la competencia halter.